來自華盛頓大學的蛋白質摺疊遊戲 Foldit 由電腦科學和工程學系和生物化學學系共同開發,利用人腦的 3D 圖像視覺能力、非專業領域玩家的直覺思考模式,改善現有蛋白質摺疊軟體的演算法,甚至提供具有可能性的方案,實現分散式計算與學術眾包。
▲ “This COMPUTER GAME could help stop coronavirus”(影片來源:YouTube)。
來自華盛頓大學的蛋白質摺疊遊戲 Foldit 由電腦科學和工程學系與生物化學學系共同開發,2008 年推出初始版本,透過遊戲的方式讓任何人都可以參與蛋白質結構預測,利用人腦的 3D 圖像視覺能力、非專業領域玩家的直覺思考模式,改善現有蛋白質摺疊軟體的演算法,甚至提供具有可能性的方案,實現分散式計算與學術眾包。
▲ “Looking at TOP Foldit coronavirus solutions (Plus: lab testing)”(影片來源:YouTube)。
Foldit 新增了全新關卡,為了阻止冠狀病毒感染人體細胞,正在尋找阻斷兩者的蛋白質結構。雖然對一般玩家來說要徹底理解可能稍嫌複雜,但遊戲的開發是為了「讓任何人都能參與」,Foldit 會提供一系列教學關卡,透過輔助工具解謎並獲得分數,研究人員會參考有潛力的方案並進行實驗。
(圖片來源)
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2010 年,科學期刊《自然》(Nature)上刊載的一篇論文表示 Foldit 的五萬多名用戶提供了有用的結果;2011 年,Foldit 玩家在 10 天內破解了科學家研究長達十五年仍未解的愛滋病毒的逆轉錄酶的晶體結構,幫助解讀 Mason-Pfizer 猴病毒(M-PMV)逆轉錄病毒蛋白酶的晶體結構,是擁有具體貢獻的案例。
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Foldit 的冠狀病毒謎題仍在持續更新中,無論是對遊戲有興趣或者關心疫情,任何人都可以參與,並且可能成為研究的助力,蛋白質摺疊遊戲 Foldit 可以在官網下載並免費遊玩!
Foldit|https://fold.it/
Foldit Puzzels|https://fold.it/portal/puzzles
Dappei 結語:
除了蛋白質摺疊遊戲 Foldit,由史丹佛大學 Pande Lab 開發的 Folding@home 也是研究蛋白質摺疊與摺疊錯誤過程的分散式計算計劃,日前發佈了新的計算程式以研究 COVID-19,並邀請全球電腦使用者貢獻閒置、未使用的運算資源,成為平行運算的一份子,Folding@home 是目前世界上最大的分散式計算工程。
文字編輯:Zoey
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